Meta Genomics - The study of genetic material recovered directly from environmental samples. (http://en.wikipedia.org/wiki/Metagenomics)
일반적인 연구 절차
- Sequence assembly
- 유전자 예측
- 종 다양성 분석
- 데이터 통합 및 기능 분석
- 비교 메타지놈
관련 리소스
- GOLD (Genomes Online Database): 메타지놈 프로젝트를 위한 표준화된 메타 데이터 관리 방법 제안
- MG-RAST: 메타지놈 분석 웹 서비스. 데이터를 업로드하여 분석할 수 있다.
- IMG (The Integrated Microbial Genomes): 일련의 분석기능을 갖추고 통합된 분석기능 제공
- MEGAN (MEta Genome ANalyzer): 로컬 환경에서 설치가 가능한 통합분석 환경으로 BLAST 기본 분석뿐 아니라, LCA (Lowest common ancestor) 알고리즘으로 종 다양성 분석, KEGG 기능 분류등을 수행할 수 있다[4]. 기능 분석 파이프라인은 KEGG, Pfam, InterPro, Gene Ontology 분석을 포함한다.
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