Bioinformatics problems 가운데 하나. 현재의 DNA sequencing 기술은 쪼개진 서열들에 대해서만 가능하며, 따라서 원래의 DNA로 조립하는 일이 필요하다. (http://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_assembly)

다음과 같은 세부 분야가 있다.

• EST assembly: EST 조각서열을 조립
• De novo assembly: Reference 서열이 없는 상황에서 새로 조립
  • De novo genome assembly
  • De novo transcriptome assembly (in RNA-seq)
  • De novo metagenome assembly (in Metagenomics)
• Mapping assembly: Reference에 매핑하는 방식으로 조립

관련 프로그램

* Peregrine: Peregrine이라는 30x 이상 빨라진 어셈블러. 참고 슬라이드 Assembling Human Genome in 100 Minutes

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