Next-Generation Sequencing of Circulating Tumor DNA for Early Cancer Detection
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- Hyungyong Kim
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Table of Contents
Summary #
초기에 진단하고 치료하는 것은 후반부에 진단한 것 보다 5~10배 더 효과가 있다.
Challenges for Cancer Screening #
현재의 초기진단 방법들
- Mammography in Breast cancer screening - high false-positive rate
- low dose CT in Lung cancer screening
- Prostate-specific antigen (PSA) screening
이들 방법은 단지 대리의(surrogate) 방법임. 우리는 좀 더 직접적이고, 민감하고, 특이한 방법이 필요하다.
Circulating Tumor DNA #
ctDNA somatic alteration 뿐만 아니라, tumor-derived RNA, DNA methylation 패턴도 알 수 있음
ctDNA Detection #
TCGA 예에서 볼 수 있듯이 암은 매우 다양하다. 환자 특이한 미세 환경과 Immune system이 암의 진화와 생존에 영향을 준다. 감염성 질환과 다르게 암은 모두 개별적이다. 그리고, heterogeneous collection of many disease로 보인다.
초기에 ctDNA 를 발견한 증거도 있다. (Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies Scientific Translational Medicine ) 그러나 자세히 연구되지 않음.
Challenges of Developing a ctDNA-Based Screening Test #
정상인에 대한 지속적인 실험도 필요하다. False positive를 구분하기 위해.
serial mesearment 또한 중요하다.
수술 후 재발을 예측하는 용도로도 쓰인다. (Circulating tumor DNA analysis detects minimal residual disease and predicts recurrence in patients with stage II colon cancer Scientific Translational Medicine )
GRAIL이란 회사를 세워서 개발중. Circulating Cell-Free Genome Atlas (CCGA) 과제에서 10,000 이상 연구하고 있음. 그리고, Cancer Moonshot Initiative는 Blood Profile Atlas Project를 시작함.
GRAIL 회사는 NGS, Machine learning을 이용하여 정상, 암 환자 구분 시도중.
Conclusions #
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