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Structured data

Cancer genomics

The cBioPortal for Cancer Genomics provides visualization, analysis and download of large-scale cancer genomics data sets.

TCGA 등 주요한 암 데이터를 분석하고 결과를 별도로 가시화 도구로 제공함. 자신의 데이터도 이곳에 등록시킬 수 있음.

It's developed and maintained by the Computational Biology Center at Memorial Sloan-Kettering Cancer Center and the i-Vis (Information Visualization) Research Group of the Computer Engineering Department at Bilkent University.


  • 특정 암 유전체 연구 혹은 전체 연구에 대해 유전자 목록을 입력하면, 다음 정보를 제공함
    1. OncoPrint: 유전자, 샘플별 변이현황
    2. Mutual Exclusivity: 유전자별 상호 관계
    3. Plots: 발현량 차트
    4. Mutation: 유전자 기준 세부 변이 현황
    5. Co-Expression: 발현 패턴 유사 유전자 확인
    6. Protein Changes
    7. Survival: Survival analysis
    8. Network: Biological network 분석
    9. IGV: Genome browser 연결
  • Web API
  • R Package


  • The NCI as a TCGA Genome Data Analysis Center (GDAC)
  • The NCRR as the National Resource for Network Biology (NRNB) Research Resource

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