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Haplotype #
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A haplotype is, in the simplest terms, a specific group of genes or alleles that progeny inherited from one parent. (http://en.wikipedia.org/wiki/Haplotype)

하플로타입(Haplotype) 용어는 haploid(반수체) genotype(유전형)의 축약형이다. 유전학에서 하플로타입은 동일 염색체상 복수좌위에서의 대립형질의 조합을 의미한다. 하나의 좌위에서 유전자 재조합에 따른 염색체 전체의 좌위들까지 해당될 수 있다. (위키백과 하플로타입 번역은 Hyungyong Kim이 했다고 전해짐)

NGS 데이터로부터 Haplotype을 알기 위해서는 imputation을 해야 한다. 다음과 같은 프로그램들이 사용됨.

  1. BEAGLE
  2. IMPUTE2

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