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Gattaca #
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Actor
Ethan Hawke
Jude Law
Uma Thurman
Date Published
Director
Andrew Niccol
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제목에서 나오는 DNA서열이 무슨 관계가 있는건가 고민했는데... 그냥 임의로 만든 제목같다.. 아직은 저 염기서열이 의미하는 것이 뭔지는 모르겠다

일단 보고 느낀점...

  • 진정한 인간의 능력은 Gene만으로 결정되지 않는다.
  • 아무리 생명과학이 발달하더라도... 인간이란 존재는 유전자 이상의 무언가이다.
  • 과학의 최전선에 있는 모두들이 다시한번 맘속에 집고 넘어가야 할것이다.
  • 뭐랄까... 의지력... 맞나? 암튼 그건 선천적이지 않으며, 유전적 우월성을 가진것보다 더 큰 영향력을 갖는다... 인간이기때문에 가질 수 있는 현상이랄까

다른 종에서는 찾기 힘든 현상일듯...

유전적으로 우월했던 동생과의 죽음을 건 수영시합을 하면서 주인공이 한말..

난 돌아갈 자리를 보지않아~~

그 주인공의 꿈을 향한 무한한 노력들... 돌아갈 자리를 보지않고 오직 꿈만을 향해 고군분투하는 그의 모습에서 나약하기만한... 돌아갈 자리를 챙기기에 급급한 나 자신의 모습을 보았다.

또한...

DNA나선 모양의 계단을 힘겹게 올라가는 주인공의 친구 불구자의 모습... 이건 제작자의 영화를 얘기하는 숨은 의도가 보인다. 진정한 가치를 위해 노력하는 인간의 모습이라고나 할까. 쉽게 이해되지 않는 뭐랄까.. 약간은 추상적인 의미를 내포하고 있다고 하겠다...

빼놓을 수 없는것이 과학을 하는 입장에서의 현란한 미래의 모습들..

  • 현재 인간 Genome을 해독하는데 10년 이상이 걸리는 것을...
  • 영화에서는 머리카락샘플하나만 가지고 몇초안에 LargeScaleSequencing을 끝내고 total sequence를 print해서 보여준다.. 헐~
  • 웃긴장면... 5분전까지 키스중이였다며 남자친구의 DNA 분석을 요구하며 입술에 묻은 타액을 채취하는장면... 헐~

현재 Human Genome Project가 빨라진 이유중의 하나가 WholeGenomeShotGun 방법이라고 하던데... 그 방법은 무작위로 전체서열을 잘라낸후 각각 sequencing하고 짜맞추는 거라던가.. 암튼, 그 방법을 쓸 수 있는 이유는 컴퓨터의 발달로 짜맞추는 일을 빠르게 할 수 있는거고... 현재로선... 그일이 몇초내에 된다는건 무리일듯... 컴퓨터가 빨라지는 것만으로 안될일같다

더욱 현란한것은 혈액샘플을 DnaMicroArray같은 곳에 놓기만 하면 그사람의 신상명세가. LargeScaleSequencing을 그 짧은 시간내에 한건지... 아님 SNP만을 분석한건지.. 영화에선 나오지 않지만... 서열 결과이든 SNP결과이든 그 결과물을 주민등록 Database와 비교하여 바로 그자리에서 결과를 보여준다는건 Bioinformatics에서 할수 있는일의 극치를 보여주는듯.. 물론 그것 이외에 생물정보학에서 할 수 있는 일은 무궁무진하겠지만... 일단은 그렇게 보인다.

마지막으로 원세연박사님의 말뜻이 아직 잘 이해가 안간다...

메일링리스트에 보낸 글 중에

그 밖에 또 무슨 설명들을 추가해야 할지... 아참, 서울은 아직 이 부분 강의를 하지 않았다는 점도 있군요. 음, 흥미로울 것도 같아 약간 추가... 영화 가타카를 다들 보셨나요? 꼭 보시기 바랍니다. GATTACA라는 서열로 BLAST를 검색하면 아무 것도 걸리지가 않습니다. 왜 그럴까요? 이를 단백질 서열로 가정을 하고(그래도 되겠죠?) 검색을 해도 역시 아무 것도 걸리지 않습니다. 왜 그럴까요? GATTACCA로 하고 단백질 서열로 가정을 해도 역시 아무 것도 걸리지 않습니다. GGATTACCA로 하고 단백질 서열로 가정을 해도 역시 아무 것도... 그런데 nr 대신에 swissprot 데이터베이스에 대해 검색을 하면? 역시 아무 것도 걸리지 않습니다. 그런데, expected value의 cutoff를 1000으로 하면 드디어 서열 두 개가 걸립니다. 왜 그럴까요?

궁금함을 못참는 나로선 또 BLAST검색을 해봤는데... expected value cutoff를 1000으로 해봐도 암것도 안걸렸다... PubMed에서 검색을 했더니...

GATTACA rising: sorting sperm by favored traits J Womens Health. 1998 Oct;7(8):933-4 이라고 나오는데.. 초록은 없다고 하고 보니깐.... 재능있는 형질을 갖는 정자와 관련된듯... 그 정자를 선별하는데 GATTACA 함량이 높다는 뜻인가?

어쨌건 그와 비슷한거라면 영화제목이 GATTACA라는건 의미가 있는거구...

서열정보중에 보니깐 곤충의 한 종류인 Lasioglossum gattaca 라는 곤충이 있던데... 그것과 관계가?

암튼, 아직 원박사님의 그말은 이해가 잘 안가고 있습니다.

--Hyungyong Kim,

제 생각으로는 gattaca라는 글자와 상관 없는 query string의 갯수가 20개 정도 보다 작을 경우 생기는 문제를 말하는것 같네요. 아래와 같은 설명이 있던데요.

Q: Causes for "No significant similarity found".

Below are several reasons that a BLAST search can result in the "No significant similarity found" message. Note: You may need to use more than one of these options at the same time (example: increase the Expect value AND turn off filtering).

Short Sequences: Depending on sequence composition, a short sequence is a sequence under 20 residues

  1. Try increasing the Expect value using the pull down tab. You can raise the E value even further than 1000 by using the -e option in the Other Advanced Options Box (Advanced BLAST only). Example: -e 100000

  2. You may also need to decrease the Word Size from the default (11 for nucleotides or 3 for proteins). You can decrease the word size using the -W option in the Other Advanced Options Box (Advanced BLAST only). Example: -W 2

예를 들어서 'aaaaaaa'나 'cacatat'같은 sequence를 query해도 서열이 걸리지 않습니다.

--destine

처음 이 영화를 보고 나서의 느낌은 "의지력"등은 Gene결정론과는 상반되는 것이란 생각을 했었다. Gene의 우월성보다 더 큰것은 후천적 환경에 의한 개체 자신의 "의지"일 것이라고... 하지만, 또 한편 생각해보면 꼭 그렇지만은 않은것이, GenesAboutMentalCharacter을 봐도 그렇고, 역시나 성격, 의지력등등에서도 Gene은 작용하고 있다는것. 영화에서는 오직 유전병에 안걸리는 방향으로만 디자인된 아기를 만들었는지 몰라도, 만일 성격관련 유전자마저 손을 댄다면,,, 꼭 영화같은 결말은 일어나지 않을수도 있겠다싶은 느낌... 역시나 자연/우주의 입장에선 인간이란 미미한 존재에 불과한걸까. --Hyungyong Kim,

얼마전, 공연하러 가던 차안에서 대화. 우연히 이 영화 제목이 나왔고, 난 이 영화의 그 대사를 좋아한다고 했다. 그 역시 같은 이야기를...

I never saved anything for the swim back!

--Hyungyong Kim

구 위키에서 페이지 옮김. 마지막 로그에 재밌는 기억이 떠오름. --Hyungyong Kim,

여성생명과학기술포럼에서 이상혁 교수님 발표 때, 이 영화의 일부를 동영상으로 보여주심. 당시 잘 몰랐고 지금에야 제대로 이해되는 대사들이 있다. 아, 그리고 또 오늘 페북 타임라인에서 알게 된 이야기. Ethan Hawke와 Uma Thurman이 이 영화 후에 결혼했다고? --Hyungyong Kim,

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