cyvcf2
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- Hyungyong Kim
Structured data
- About
- VCF
- Code Repository
- https://github.com/brentp/cyvcf2
- URL
- https://brentp.github.io/cyvcf2
cython + htslib == fast VCF and BCF processing
HTSlib의 파이썬 확장 중, VCF 처리 부분을 Cython으로 최적화함.
pysam도 유사하지만, 최적화 방식을 GEMINI에 맞도록 하느라, 별도의 프로젝트를 구성했다고 함.
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