MinION is the only portable real-time device for DNA sequencing and RNA sequencing.

Flowcell 특징

• 2408개의 pore가 있으며, 실제 사용시 보통 1500개 정도만 작동함. 여러번 사용가능하지만, washing 수행중 pore가 죽는다.
• 통상 1개의 flowcell로 2~3개의 샘플 시퀀싱 가능
• 시간으로 계산하면 약 40시간 정도 러닝

MinION 장점

• Long read sequencing에 유리함
• 다양한 SV, DNA methylation 차이 확인 가능
• RNA-seq의 경우, isoform과 splicing variant를 구분할 수 있따.
• Illumina RNA-seq은 양쪽에 adapter를 붙혀야 하는데, 한쪽만 붙이면 된다.
• 런하면 바로 데이터가 나오기 때문에 초반 데이터의 퀄러티가 나쁘면 바로 멈출 수 있다.
• Prep한 DNA fragment 길이가 20kb 미만인 경우, ligation kit을 이용하는 것이 좋다.

MinION 단점

• Sequencing 정확도가 95%이며 어떤 경우 85%까지 내려가기도 한다.
• 정확도가 떨어지기 때문에 short read sequencing이나 SNP detection에는 적합하지 않다.

현재 활용되는 분야

• Sequence assembly
• Sepsis (패혈증) 진단
• 16S rRNA sequencing

관련논문

• Oxford Nanopore MinION Sequencing and Genome Assembly](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27646134) Genomics Proteomics Bioinformatics 2016-10-14

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