Biopython
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Structured data
- About
- Bioinformatics
- Code Repository
- http://github.com/biopython/biopython
- In Language
- Python
- URL
- http://biopython.org
Bioinformatics에 사용되는 많은 기능들을 Python으로 구현함. 가장 큰 특징은 "서열" 정보를 객체로 잘 정리했다는 점. GenBank등의 자료를 읽어서 객체로 쓸 수 있고, 또 BioSQL을 써서 Relational Database로도 저장할 수 있다.
Table of Contents
팁 #
SeqIO로 abi 파일 읽을 때, Applied Biosystem 3730xl 장비에서 나오는 .ab1 파일의 경우, 에러가 남 - (보고되고 1.72에서 수정됨. 대신 FSA 파일인 경우, seq, qual 정보는 없음.
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