BioSQL
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Structured data
Generic relational model covering sequences, features, sequence and feature annotation, a reference taxonomy, and ontologies.
뭔가 생물학 서열을 Relational database로 만들고 싶다면 이를 이용한다. GenBank 형식같은 복잡한 서열 정보를 온전히 DB에 저장하고, 또 추출할 수 있다.
다음의 RDBMS를 지원한다.
- SQLite
- MySQL
- PostgreSQL
- Oracle: Hyungyong Kim이 에 별도로 확장 구현함 (오라클 테스트 코드를 못만들어 커밋못함)
다음의 Bio* projects 에서 모두 이용 가능하다.
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